01 / scientific question
当单细胞规模由一万扩展到十万时，邻居图构建的时间、内存与参数选择如何共同变化？
02 / data & model
data description
从 PBMC 表达矩阵中抽取不同数量的细胞，保留 2,000 个高变基因与 50 个 PCA 分量。
model description
Scanpy neighbors，比较默认 pynndescent 与不同的 n_neighbors 设置。
03 / process
固定随机种子。每个规模运行三次，记录 wall time、峰值内存和 GPU/CPU 温度快照。
04 / results & discussion
10 万细胞时，邻居数从 15 增到 30 的图构建成本显著上升。较小的 sanity run 能提前发现内存瓶颈。